El esqueleto de las ratites es distinto al de las aves modernas:
1. Las aves modernas poseen una quilla en su esternón para la inserción de los músculos pectorales, permitiéndoles batir con fuerza sus alas. En cambio, las ratites y al igual que todos los dinosaurios extintos, tienen el esternón plano y sin quilla. Así pues, no tienen la fuerza necesaria para levantarse en el aire, ya que sus músculos pectorales son insignificantes.
2. Las ratites tienen las clavículas separadas, como un reptil. En cambio, los pájaros modernos tienen las clavículas fusionadas en un solo hueso. Esto les permite el movimiento típico de las alas al volar. Sin embargo, las alas de las ratites pueden moverse de forma muy limitada, generalmente hacia delante y atrás y no de arriba a abajo.
3. Las alas de las ratites son muy cortas respecto a su cuerpo, en comparación a las aves modernas. De hecho, el avestruz es el ave con el mayor número de dedos en su ala (conservando aún las garras originales de la mano).
Las plumas también se adaptan a las necesidades de las aves. Las ratites poseen plumas primitivas cuya función es el aislamiento de calor o frío y sirven también para el cortejo. Estas plumas se caracterizan por tener los filamentos separados, siendo así inútiles para volar. En cambio, las plumas de las aves modernas poseen micro ganchos para unir los filamentos. De esta forma, son capaces de empujar el aire y levantar su cuerpo.